
زندگینامه علمی
دکتر گلیائی استادیار دانشکده است. ایشان کارشناسی و کارشناسیارشد مهندسی کامپیوتر خود را از دانشگاه صنعتی شریف و دکتری را از دانشگاه تربیت مدرس دریافت کرده است.
زمینههای پژوهشی ایشان بیوانفورماتیک و زیستشناسی محاسباتی (تحلیل دادههای تکسلولی و شبکههای تنظیم ژنی)، الگوریتمهای گراف و شبکههای پیچیده، سامانههای توصیهگر و محاسبات نامتعارف است.
سوابق تحصیلی
- دکتری۱۳۸۶ – ۱۳۹۷
مهندسی کامپیوتر (نرم افزار)
دانشگاه تربیت مدرس
- کارشناسیارشد۱۳۸۴ – ۱۳۹۷
مهندسی کامپیوتر (نرم افزار)
دانشگاه صنعتی شریف
- کارشناسی۱۳۸۰ – ۱۳۹۷
مهندسی کامپیوتر (نرم افزار)
دانشگاه صنعتی شریف
گزیدهٔ مقالات اخیر
همهٔ مقالات · ۴۲- ۱۴۰۱
Distinct Dynamics of Migratory Response to PD-1 and CTLA-4 Blockade Reveals New Mechanistic Insights for Potential T-Cell Reinvigoration following Immune Checkpoint Blockade
CELLS
- ۱۴۰۱
Demonstration of cellular dynamic behavior in response to DNA damage through gene regulatory network analysis of single-cell resolution DNA repair phenotype and gene expression multi-omics dataset
The first international conference and the tenth national bioinformatics conference of Iran
- ۱۴۰۰
Embedding ranking-oriented recommender system graphs
EXPERT SYSTEMS WITH APPLICATIONS
- ۱۴۰۰
Conifer: clonal tree inference for tumor heterogeneity with single-cell and bulk sequencing data
BMC BIOINFORMATICS
زمینههای پژوهشی
- بیوانفورماتیک و زیستشناسی محاسباتی
- الگوریتمهای گراف و شبکههای پیچیده
- سامانههای توصیهگر
- محاسبات نامتعارف
۴۲ مقاله
۱۴۰۱
Distinct Dynamics of Migratory Response to PD-1 and CTLA-4 Blockade Reveals New Mechanistic Insights for Potential T-Cell Reinvigoration following Immune Checkpoint Blockade
Fatemeh Safaeifard, Bahram Golyaei, amir aref, MOHAMMAD-HADI FOROUGHMAND-ARAABI, Sama Goliaei, Jochen Lorch, Jenkins Russel, David Barbie, Seyed Peyman Shariatpanahi, Ruegg Curzio
CELLS · Vol. 11, No. 1
مجلهDemonstration of cellular dynamic behavior in response to DNA damage through gene regulatory network analysis of single-cell resolution DNA repair phenotype and gene expression multi-omics dataset
Abolfazl Arab, Sama Goliaei, Faramarz Mehrnejad
The first international conference and the tenth national bioinformatics conference of Iran
همایش
۱۴۰۰
Embedding ranking-oriented recommender system graphs
Taher Hekmatfar, Saman Haratizadeh, Sama Goliaei
EXPERT SYSTEMS WITH APPLICATIONS · Vol. 181, No. 1
مجلهConifer: clonal tree inference for tumor heterogeneity with single-cell and bulk sequencing data
Leila Bagha Arabani, Sama Goliaei, MOHAMMAD-HADI FOROUGHMAND-ARAABI, Seyed Peyman Shariatpanahi, Bahram Golyaei
BMC BIOINFORMATICS · Vol. 22, No. 1
مجلهNew recommender system evaluation approaches based on user selections factor
Mohamad Kshour, Morteza Ebrahimi, Sama Goliaei, Rami Tawil
Heliyon · Vol. 7, No. 7
مجلهAbstract Geometrical Computation 10: An Intrinsically Universal Family of Signal Machines
Florent Becker, Tom Besson, Jerome Durand-lose, Aurelien Emmanuel, MOHAMMAD-HADI FOROUGHMAND-ARAABI, Sama Goliaei, SHAHRZAD HEYDARSHAHI
ACM Transactions on Computation Theory · Vol. 13, No. 1
مجله
۱۳۹۹
Centralized Path Planning for Multi-aircraft in the Presence of Static and Moving Obstacles
Masoud Mirzaei Teshnizi Mirzaei Teshnizi, Amir Reza Kosari, Sama Goliaei, Saeed Shakhesi
International Journal of Engineering, Transactions B: Applications · Vol. 33, No. 5
مجلهA Novel Pattern Matching Algorithm for Genomic Patterns Related to Protein Motifs
Mohammad-hadi Foroughmand-araabi, Sama Goliaei, Bahram Golyaei
Journal of Bioinformatics and Computational Biology · Vol. 18, No. 1, pp. 2050011-1
مجلهEvaluating Nondeterministic Signal Machine Relative Complexity: A case study on Dominating Set Problem
Sahar Ardalan, Sama Goliaei, Ayaz Isazadeh
International Journal of Innovative Computing and Applications · Vol. 11, No. 1
مجله
۱۳۹۸
The number of followings as an influential factor in rumor spreading
Amirhosein Bodaghi, Sama Goliaei, Mostafa Salehi
APPLIED MATHEMATICS AND COMPUTATION · Vol. 357, No. 1, pp. 167-184
مجلهA Game-Theoretical Network Formation Model for C.elegans Neural Network
Mohammad Khajezadeh, Sama Goliaei, Hadi Veisi
Frontiers in Computational Neuroscience · Vol. 13, No. 1
مجلهCAMIRADA: Cancer microRNA association discovery algorithm, a case study on breast cancer
Sepideh Shamsizadeh, Sama Goliaei, Zahra Razaghi Moghadam Kashani
JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS · Vol. 94, No. 1
مجلهA Boolean network control algorithm guided by forward dynamic programming
Mohammad Moradi, Sama Goliaei, Mohammad-hadi Foroughmand-araabi
PLoS One · Vol. 1, No. 1, pp. 1-21
مجله
۱۳۹۷
A NOVEL MODEL FOR RUMOR SPREADING ON SOCIAL NETWORKS WITH CONSIDERING THE INFLUENCE OF DISSENTING OPINIONS
Amirhosein Bodaghi, Sama Goliaei
ADVANCES IN COMPLEX SYSTEMS · Vol. 21, No. 6, pp. 1850011-1
مجلهModeling the Probability Distribution of the Bacterial Burst Size via a Game-Theoretic Approach
Seyed Amir Malekpour, Parsa Pakzad, Mohammad-hadi Foroughmand-araabi, Sama Goliaei, Ruzbeh Tusserkani, Bahram Golyaei, Mehdi Sadeghi
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY · Vol. 16, No. 4, pp. 1850012-1
مجلهA novel algorithm to identification of breast cancer biomarkers
Masoumeh Oveisi, Sama Goliaei, Zahra Razaghi Moghadam Kashani
The 7th Conference of Bioinformatics
همایش
۱۳۹۶
Computational Complexity of Wavelength-Based Machine with Slightly Interacting Sets
Sama Goliaei, Mohammadhadi Foroughmandaraabi
International Journal of Unconventional Computing · Vol. 13, No. 2, pp. 117-137
مجلهCytoGTA: A cytoscape plugin for identifying discriminative subnetwork markers using a game theoretic approach
Saman Farahmand, Mohammad Hadi Foroughmand, Sama Goliaei, Zahra Razaghi Moghadam Kashani
PLoS One · Vol. 12, No. 10
مجلهPersonalized Cancer Driver Gene Identification, A Network Based Approach
Ghazaleh Niknam, Sama Goliaei, Zahra Razaghi Moghadam Kashani
The 7th Conference on Bioinformatics
همایشIntrinsic Universal Family of Signal Machines
Mohammadhadi Foroughmandaraabi, Jerome Durand-lose, Florent Becker, Sama Goliaei
International Conference of New Worlds of Computation 2017
همایشDealing with Nondeterminism in Signal Machines
Rakhshan Harifi, Sama Goliaei
International Conference of New Worlds of Computation 2017
همایش
۱۳۹۵
HybridRanker: Integrating network topology and biomedical knowledge to prioritize cancer candidate genes
Zahra Razaghi Moghadam Kashani, Razieh Abdollahi, Sama Goliaei, Morteza Ebrahimi
JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS · Vol. 64, No. 1, pp. 139-146
مجلهA Wearable Device for Continuous Cardiorespiratory System Monitoring
Negar Mohammadi, Hamidreza Memarzadeh Tehran, Sama Goliaei
The 41st IEEE Conference on Local Computer Networks (LCN)
همایشA Nondeterministic Model for Abstract Geometrical Computation
Rakhshan Harifi, Sama Goliaei
Computability in Europe 2016
همایش
۱۳۹۴
GTA: a Game Theoretic Approach to Identifying Cancer Subnetwork Markers
Saman Farmhand, Sama Goliaei, Naser Ansari Pour, Zahra Razaghi Moghadam Kashani
Molecular BioSystems
مجلهComputation with optical sensitive sheets
Sama Goliaei, سعید جلیلی
Natural Computing · Vol. 14, No. 3, pp. 1-14
مجلهIdentifying Cancer Subnetwork Markers Using Game Theory Method
Saman Farmhand, Sama Goliaei, Zahra Razaghi Moghadam Kashani, Sina Farahmand
International Conference on Biomedical and Health Informatics
همایشAssociating Protein Interactions with Disease Comorbidity to Prioritize Colorectal Cancer Genes
Seyyedeh Razieh Abdollahi Demneh, Sama Goliaei, Zahra Razaghi Moghadam Kashani
International Conference on Biomedical and Health Informatics
همایشارائه الگوریتمی جهت کنترل شبکه های بولی
محمد مرادی، سما گلیائی
دومین کنفرانس بین المللی کاربرد فناوری های نوین در علوم مهندسی
همایش
۱۳۹۳
Codon usage and protein sequence pattern dependency in different organisms: a Bioinformatics approach
Mohammad-hadi Foroughmand-araabi, Bahram Golyaei, Kasra Alishahi, Mehdi Sadeghi, Sama Goliaei
Journal of Bioinformatics and Computational Biology · Vol. 13, No. 2
مجلهA 2-dimensionalopticalarchitectureforsolvingHamiltonian path problembasedonmicroringresonators
Nadim Shaker, سعید جلیلی, وحید احمدی, Aref Rasoulzadehzali, Sama Goliaei
OPTICS AND LASER TECHNOLOGY · Vol. 65, No. 1, pp. 56-65
مجلهOn the complexity of nonuniform wavelength-based machine
Sama Goliaei, Mohammad-hadi Foroughmand-araabi
Natural Computing · Vol. 13, No. 2, pp. 269-283
مجلهGlobal Topology of Codon Usage Equality Networks of Escherichia coli Essential Genes
Sama Goliaei, Mohammad-hadi Foroughmand-araabi
International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering
همایش
۱۳۹۲
Light Ray Concentration Reduces the Complexity of the Wavelength-Based Machine on PSPACE Languages
Sama Goliaei, Mohammad-hadi Foroughmand-araabi
Lecture Notes in Computer Science · Vol. 7956, No. 1, pp. 90-101
مجلهAn Optical Polynomial Time Solution for the Satisfiability Problem
Sama Goliaei, سعید جلیلی
Lecture Notes in Computer Science · Vol. 7715, No. 1, pp. 15-24
مجلهAn Optical Wavelength-Based Computational Machine
Sama Goliaei, سعید جلیلی
International Journal of Unconventional Computing · Vol. 9, No. 1
مجلهLight Ray Concentration Reduces the Complexity of the Wavelength-Based Machine on PSPACE Languages
Sama Goliaei, Mohammad-hadi Foroughmand-araabi
12th International Conference of Unconventional Computation and Natural Computation
همایش
۱۳۹۱
An optical solution to the 3-SAT problem using wavelength based selectors
Sama Goliaei, سعید جلیلی
JOURNAL OF SUPERCOMPUTING · Vol. 62, No. 2, pp. 663-672
مجلهLight-Based Solution for the Dominating Set Problem
Sama Goliaei, سعید جلیلی, Javad Salimi Sartakhti
APPLIED OPTICS · Vol. 29, No. 51, pp. 6979-6983
مجلهLower Bounds on the Complexity of the Wavelength-Based Machine
Sama Goliaei, Mohammad-hadi Foroughmand-araabi
Lecture Notes in Computer Science · Vol. 7445, No. 1, pp. 94-105
مجلهLower Bounds on the Complexity of the Wavelength-Based Machine
Sama Goliaei, Mohammad-hadi Foroughmand-araabi
11th International Conference Unconventional Computation & Natural Computation 2012
همایشAn Optical Polynomial Time Solution for the Satisfiability Problem
Sama Goliaei, سعید جلیلی
Optical Supercomputing 2012
همایش
درسهای ارائهشده توسط عضو هیئتعلمی در سامانهٔ آموزش دانشگاه، به تفکیک درس. سابقهٔ نیمسالها در ادامه آمده است.
- 092-05-83۳ واحد
الگوریتم های گراف
- تعداد ارائه
- ۲
- آخرین ارائه
- نیمسال دوم ۱۴۰۰–۱۴۰۱
- 399-04-83۳ واحد
بیوانفورماتیک
- تعداد ارائه
- ۱
- آخرین ارائه
- نیمسال دوم ۱۴۰۰–۱۴۰۱
- 065-05-83۳ واحد
نظریه بازی ها
- تعداد ارائه
- ۱
- آخرین ارائه
- نیمسال اول ۱۴۰۰–۱۴۰۱
- 141-05-83۳ واحد
طراحی واسط کاربر
- تعداد ارائه
- ۱
- آخرین ارائه
- نیمسال اول ۱۴۰۰–۱۴۰۱
سابقهٔ ارائه به تفکیک نیمسال
نیمسال دوم ۱۴۰۰–۱۴۰۱
| کد درس | نام درس | واحد | زمان ارائه |
|---|---|---|---|
| 092-05-83 | الگوریتم های گراف | ۳ واحد | هرهفته, 13:30-15:30 |
| 399-04-83 | بیوانفورماتیک | ۳ واحد | هرهفته, 15:30-17:30 |
نیمسال اول ۱۴۰۰–۱۴۰۱
| کد درس | نام درس | واحد | زمان ارائه |
|---|---|---|---|
| 065-05-83 | نظریه بازی ها | ۳ واحد | هرهفته, 15:00-17:00 |
| 092-05-83 | الگوریتم های گراف | ۳ واحد | هرهفته, 13:00-15:00 |
| 141-05-83 | طراحی واسط کاربر | ۳ واحد | هرهفته, 08:00-10:00 |
پایاننامهها و رسالههای دفاعشده با راهنمایی این عضو هیئتعلمی، به ترتیب از جدیدترین.
رسالههای دکتری
۶Improvement of recommender system evaluation rules based on human behavior
دانشجومحمد قشور
تحلیل روند تکاملی تومور بر مبنای داده های تک سلول
دانشجولیلا بقاعربانی
مدلسازی مبتنی بر یادگیری عمیق در سیستمهای توصیه گر
دانشجوطاهر حکمت فر
مدلسازی و کنترل ترافیک هوایی پرنده های بدون سرنشین با استفاده از نظریه بازی
دانشجومسعود میرزائی
مدل سازی انتشار شایعه در شبکه های اجتماعی برخط
دانشجوامیرحسین بداغی
بهبود مسیریابی در اینترنت اشیاء به منظور افزایش عمر شبکه و کاهش از دست دهی بسته
دانشجوسیدرضا تقی زاده
پایاننامههای کارشناسیارشد
۲۷تحلیل شبکه فنوتیپ ترمیمDNA با استفاده از پایگاه داده سنجش ژنتیکی با رویکرد نانوبیوممتیک در دقت تکسلولی
دانشجوابوالفضل عرب
استنتاج درخت فیلوژنی تومور متاستازی سرطان با استفاده از توالی تک سلولی
دانشجوسارا زمانی
هم تراز سازی سراسری چندگانه شبکه های تعامل پروتئین - پروتئین
دانشجوشادی میرزایی
ارائه الگوریتم ابتکاری برای همترازی چندگانه در شبکه های تعامل پروتئین - پروتئین
دانشجومحمدهادی رهجو
تقریب برخورد در ماشین سیگنال با مجموعه سرعت های ثابت
دانشجوسعیده افشاری
تشخیص خودکار کنایه در متون فارسی رسانه های اجتماعی
دانشجورامین اسفندیاری کته
کشف مسیر تکاملی تومور با استفاده از داده های تک سلول
دانشجونیلوفر ابهری گلسفیدی
مدل سازی مهاجرت سلول در شرایط آزمایشگاهی
دانشجوفاطمه صفایی فرد
ارائه الگوریتمی برای همتراز سازی شبکه های تعامل پروتئین - پروتئین
دانشجومهتاب شاهسون بغدادی
ارائه ی الگوریتمی به منظور شناسایی ژنهای محرک سرطان
دانشجوغزاله نیکنام شیروان
ارائه الگوریتم جدید به منظور شناسایی میکرو آر. ان. ای. های مرتبط با سرطان
دانشجوسپیده شمسی زاده
ارائه ی یک الگوریتم برای تشخیص ژنهای سرطانی با استفاده از اطلاعات کدون
دانشجوبهزاد محمدصالحی
شناسائی زیرگروههای سرطان با استفاده از جهش های سوماتیک
دانشجومحسن فلاحت
معرفی الگوریتمی برای شناسایی جاذب ها در شبکه های بولی
دانشجومرتضی عبداللهی
ارائه ی روش تلفیقی مبتنی بر شبکه جهت اولویت بندی ژنهای درگیر در سرطان
دانشجوسیده رضیه عبداللهی دمنه
تشخیص انجمن های هم پوشان در شبکه های اجتماعی با استفاده از روشهای احتمالی
دانشجومهدی حاجی آبادی
پیش بینی بیماری سرطان با استفاده از شبکه های بیزی
دانشجوجابر مرادنژاد
شناسایی جهش های مرتبط با سرطان پستان در ارتباط با نواحی عملکردی پروتئین
دانشجومهنا فرهادی
طراحی و پیاده سازی پروتکل دسترسی به رسانه Heartbeat-Respiration Driven به منظور بکارگیری در فونوکاردیوگرافی بی سیم
دانشجونگار محمدی کوشکی
تعیین موقعیت های بهینه مراکز درمانی و اورژانس ها با استفاده از الگوریتم تصمیم گیری چندهدفه فازی
دانشجومجید میرزائی مدام
شناسائی نشانگرهای زیستی سرطان با رویکرد نظری? بازی ها
دانشجوسامان فرهمند
ارایه ی الگوریتمی جهت کنترل شبکه های پولی
دانشجومحمد مرادی
تحلیل تئوری بازی ها در توسعه پایدار انرژی سیستم حمل و نقل شهری
دانشجوسیدمحمد شجاعی
تحلیل ساختاری شبکه های عصبی زیستی با استفاده از نظریه بازی
دانشجومحمد خواجه زاده
تعریف و بررسی مدل غیر قطعی محاسبات هندسی انتزاعی
دانشجورخشان حریفی
ارائه ی الگوریتم به منظور یافتن سیگنال ماشین شبکه ای معادل با ماشین تورینگ تناوبی
دانشجوداود حسن زاده
ارائه ی الگوریتمی به منظور شناسایی نشانگرهای زیستی سرطان پستان
دانشجومعصومه اویسی
- تألیف۱۳۹۸
IFMBE Proceedings
Saman Farahmand, Sama Goliaei, Zahra Razaghi Moghadam Kashani, Sina Farahmand
ناشرSpringer, Singapore
- تألیف۱۳۹۸
IFMBE Proceedings
Seyyedeh Razieh Abdollahi Demneh, Sama Goliaei, Zahra Razaghi Moghadam Kashani
ناشرSpringer, Singapore
مسئولیتهای اجرایی و مدیریتی در دانشگاه و جامعهٔ علمی.
- ۱۳۹۳
مطالعه و پژوهش در الگوریتم های استخراج موتیف در شبکه های متنی
عضویت در کمیته علمی ششمین همایش بیوانفورماتیک ایران



